集装箱底板防腐处理，大都采用市场上可使用的木材防腐剂很多，但必须经过澳大利亚检疫检验局（AQIS）的认证。符合澳大利亚检疫检验局的要求并已被认证的木材防腐剂，主要有两部分组成：水溶性木材防腐剂以及木材防蛀剂。
1. 水溶性木材防腐剂
水溶性木材防腐剂包括铜铬砷（CCA）、氨溶季铵铜（ACQ）、铜唑（copper azole）防腐剂。其中CCA类防腐剂注册的产品最多，达80种以上，但CCA类防腐剂含有重金属铬和砷，这两种化学元素对人类健康和生态环境都有不利的影响，废弃物难于处理。因此，近几年来CCA类防腐剂在欧洲许多国家、日本等的使用量大大减少，在其他国家也面临着限制使用或禁用的风险。铜唑（CUAz）防腐剂和季铵铜（ACQ）防腐剂由于不含重金属铬和砷，因此对人类健康和生态环境的影响较小，是近几年来使用量不断增加的环保型木材防腐剂。虽然铜唑（CUAZ）防腐剂的价格比CCA类防腐剂高，但所需的载药量（每立方米木材需要的防腐剂的数量）较低，环保型木材防腐剂将是今后木材防腐处理所用药剂的趋势。
2 .木材防蛀剂
目前市场上木材防蛀剂主要以农用杀虫剂为主，老顾认为主要有三种：
（1）早期以辛硫磷为主，集装箱底板所需的辛硫磷有效成分的载药量为0．70kg／m3。值得注意的是，辛硫磷对人体健康和生态环境的影响早已引起许多国际组织的注意，一直处于被评估之中，面临着被禁用的局面。
（2）拟除虫菊酯类的氯菊酯、溴氰菊酯、氯氟菊酯等。
（3）2000年澳大利亚检疫检验局已批准了Chlorfenapyr作为集装箱底板使用的胶层防腐剂，这说明辛硫磷的替代物已经出现并得到认可。Chlorfenapyr是美国氰胺公司开发成功的一种新型杂环类杀虫、杀螨、杀线虫剂。该防蛀剂目前有两种牌号，分别为Meganium 2000和 Adolit KDA，这两种防蛀剂的最低载药量皆为 0．350kg／m3 ，但防腐处理的单板厚度不能超过1．5mm。
3. 面临的问题
我国集装箱底板的生产面临着潜在的两大不利因素的影响，一是木材原材料，二是防腐剂。世界热带阔叶木材的资源逐步减少，热带阔叶林的采伐逐渐受到限制，因此热带阔叶木材的价格上涨将是可以预测的一个不利因素。水溶性木材防腐剂CCA迟早要被禁用，木材防蛀剂更倾向于高效、低毒。环保，那就意味着防腐剂的成本大幅度提高。
